MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 24579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	T	9	9	1205	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013790	T	6	6	1225	1230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013790	T	9	9	1232	1240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013790	ATT	2	6	1242	1247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013790	T	6	6	1246	1251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013790	TTA	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013790	T	8	8	1271	1278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013790	GAT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013790	T	7	7	1293	1299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013790	T	6	6	1301	1306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013790	TG	3	6	1315	1320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013790	TTCTT	2	10	1335	1344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013790	T	7	7	1343	1349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013790	T	11	11	1351	1361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013790	T	6	6	1373	1378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013790	TTTTTC	2	12	1391	1402	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013790	T	6	6	1403	1408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013790	CAT	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013790	TAAA	2	8	1453	1460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013790	TAA	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013790	A	6	6	1477	1482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013790	AT	3	6	1488	1493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013790	AAT	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013790	TAA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013790	AT	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013790	T	6	6	1567	1572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013790	ATTA	2	8	1586	1593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013790	A	6	6	1636	1641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013790	AGAA	2	8	2381	2388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013790	AAT	2	6	2411	2416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013790	ATTT	2	8	2424	2431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013790	GAT	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013790	TTA	3	9	2438	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013790	TAGT	2	8	2456	2463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013790	AT	3	6	4795	4800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013790	T	6	6	4822	4827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013790	T	7	7	4838	4844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013790	T	6	6	4853	4858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013790	AATT	2	8	4859	4866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013790	AT	3	6	4897	4902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013790	AT	3	6	4919	4924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013790	ACA	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013790	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013790	TTAAT	2	10	4981	4990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013790	TAA	2	6	5003	5008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013790	T	6	6	5009	5014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013790	TTAA	2	8	5017	5024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013790	ATT	2	6	5038	5043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013790	TGA	3	9	5071	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013790	A	9	9	5179	5187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013790	TCC	2	6	7479	7484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013790	ATT	2	6	7485	7490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013790	TA	4	8	7498	7505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013790	ATT	2	6	7506	7511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013790	T	7	7	7529	7535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013790	TAT	2	6	7550	7555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013790	A	7	7	7557	7563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013790	T	8	8	7632	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013790	T	8	8	7678	7685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013790	T	7	7	7724	7730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013790	TAT	2	6	8722	8727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013790	ATT	2	6	8776	8781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013790	AT	3	6	8797	8802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013790	T	6	6	8802	8807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013790	TTCT	2	8	8818	8825	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013790	T	7	7	9369	9375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013790	ATT	2	6	9380	9385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013790	TAT	2	6	9387	9392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013790	AAT	2	6	9406	9411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013790	ATA	2	6	9423	9428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013790	ATA	2	6	9437	9442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013790	AG	3	6	9447	9452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013790	TAT	2	6	9454	9459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013790	CTT	2	6	9468	9473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013790	AAT	2	6	9485	9490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013790	ATT	2	6	9524	9529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013790	TAT	2	6	9583	9588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013790	ATTC	2	8	9597	9604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013790	TAAT	2	8	10442	10449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013790	TATTT	2	10	10469	10478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013790	ATT	2	6	10484	10489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013790	GGT	2	6	10510	10515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013790	TG	3	6	10534	10539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013790	TTG	2	6	10547	10552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013790	ATTTT	2	10	10567	10576	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013790	TGTGG	2	10	10577	10586	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013790	ATTA	2	8	10642	10649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013790	T	7	7	10666	10672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013790	T	8	8	10685	10692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013790	ATTT	2	8	10694	10701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013790	TA	3	6	10702	10707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013790	TTA	2	6	10722	10727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013790	GTT	2	6	10734	10739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013790	A	6	6	10787	10792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013790	AAT	2	6	10826	10831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013790	ATTA	2	8	10843	10850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013790	T	7	7	12363	12369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013790	ATG	2	6	12384	12389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013790	ATT	2	6	13174	13179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013790	T	6	6	13192	13197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013790	T	6	6	13214	13219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013790	AATTC	2	10	13220	13229	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013790	T	7	7	13240	13246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013790	TTTTA	2	10	14193	14202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013790	TAT	2	6	14210	14215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013790	ATT	2	6	14219	14224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013790	ATT	2	6	14238	14243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013790	T	8	8	14281	14288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013790	ATT	2	6	14289	14294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013790	TCTTT	2	10	14303	14312	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013790	T	8	8	14315	14322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013790	ATT	2	6	14323	14328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013790	TAA	2	6	14351	14356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013790	T	6	6	14371	14376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013790	ATT	2	6	14385	14390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013790	A	6	6	14394	14399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013790	TA	3	6	14422	14427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013790	T	6	6	14437	14442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013790	AAT	2	6	14449	14454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013790	T	6	6	14497	14502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013790	T	6	6	14526	14531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013790	ATG	2	6	14549	14554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013790	TAA	2	6	14556	14561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013790	ATTT	2	8	14614	14621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013790	TA	3	6	14645	14650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013790	T	6	6	14658	14663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013790	ATG	2	6	14703	14708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013790	ATA	2	6	14709	14714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013790	TA	3	6	14731	14736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013790	A	8	8	14746	14753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013790	A	6	6	14980	14985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013790	T	6	6	14996	15001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013790	ATT	2	6	15003	15008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013790	T	6	6	15012	15017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013790	T	7	7	15019	15025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013790	TAT	2	6	15033	15038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013790	ATT	2	6	15097	15102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013790	A	6	6	15114	15119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013790	T	7	7	15143	15149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013790	ATA	2	6	15152	15157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013790	TA	3	6	15183	15188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013790	ATT	2	6	15193	15198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013790	ATT	2	6	15211	15216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013790	AT	3	6	15227	15232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013790	A	7	7	15294	15300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013790	TAATC	2	10	16367	16376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013790	TCT	2	6	16384	16389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013790	T	6	6	16396	16401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013790	CTT	2	6	16406	16411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013790	T	6	6	16436	16441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013790	T	8	8	16451	16458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013790	T	6	6	16481	16486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013790	ATTT	2	8	16530	16537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013790	AT	3	6	16540	16545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013790	TATT	2	8	16576	16583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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